《火影忍者》中,自来也与佩恩的对决发生在第四次忍界大战的部分。在剧情中,这个重要的战斗发生在第208集,也就是特别篇《鸣人VS佩恩》。这一集是自来也为了阻止佩恩的阴谋,独自深入晓组织基地,与佩恩六道中的五人进行激战。虽然自来也实力强大,但最终还是在战斗中牺牲,这场战斗对鸣人及其伙伴们产生了深远的影响。
自来也与佩恩的战斗主要集中在《火影忍者剧场版:鸣人VS佩恩》中,这并不是一集普通的电视动画,而是一部单独的剧场版电影。在原版的电视动画里,这个故事线被分割在多个集数中展现,相关剧情主要出现在第207、208和215话。第208话是自来也与佩恩正面交锋的高潮部分。
自来也与佩恩的决斗是在《火影忍者》系列的第四次忍界大战相关剧情中,具体来说,这个战斗场面主要集中在《火影忍者剧场版:鸣人VS佩恩》中。虽然这不是一集常规的电视动画,但该电影可以看作是动画剧情的一个重要转折点,发生在电视动画剧情的第208话,同时也是自来也悲壮牺牲的情节。